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遗传学和基因组学研究生课程
遗传学是一门研究生物遗传和变异的科学,可以追溯到格雷格•孟德尔1866年发表的开创性著作。然而,如今遗传学是生物医学研究中发展最快的领域之一。在相对较新的基因组学——生物基因组研究——的推动下,技术进步在过去几年里取得了快速进展。我们现在拥有许多基因组的完整DNA序列,能够破译调节基因表达、配置染色质结构、招募转录因子以及激活或沉默单个位点或基因网络的机制。此外,我们还可以研究基因组和表观基因组之间的串扰,即改变基因表达但不改变底层DNA序列的修饰。这些动态过程对于生物体中不同细胞类型的正常发育和分化功能至关重要,它们的失败导致了广泛的人类疾病。
西北大学是一个充满活力和互动的科学家团队的所在地,他们对遗传学、基因组学和表观基因组学的基本机制进行世界一流的、最先进的研究。遗传学和基因组学集群加强并为我们在这些学科领域的研究生提供高级培训。这是一个包容性的培训机会,适用于几所大学校园的所有学员,无论他们的主要研究领域、部门或地理位置如何。
培训机会包括:
1.最先进的研讨会。研讨会将侧重于与遗传学和基因组学相关的技术或计算生物学。最近的研讨会包括关于生物信息管道和编程技能的实践课程。
2.遗传学和基因组学研讨会。学员将选择和邀请知名科学家。其他相关研讨会系列和期刊俱乐部正在进行中。
3.年度研讨会。该活动由集群领导层和受训人员共同组织。它为大学带来了杰出的主旨发言人,包括西北大学教师和学生的演讲。研讨会为学生提供了一个展示他们在西北遗传学和基因组学社区的工作和网络的机会。
集群总监
• Christine DiDonato博士,儿科教授,人类分子遗传学项目主任,SMCRI
培训课程
1.染色质和表观遗传学。
• Jason Brickner*, PhD(IBiS)细胞核的空间组织和基因表达
• Debabrata Chakravarti*, PhD(DGP)激素信号转导和染色质修饰
• Ramana Davuluri*,博士(DGP)转化生物信息学和癌症基因组学
• Kyle Eagen*, PhD(DGP)染色质折叠和染色体分离的结构和生化基础
• Daniel Foltz*,博士(DGP)着丝点染色质组装和染色体分离
• 侯丽芳*,医学博士(DGP)疾病的环境、遗传和表观遗传危险因素
• Steve Kosak*,博士(DGP)细胞分化和疾病过程中的核形式和功能
• John Marko*,博士(IBiS)蛋白质-DNA相互作用,以及染色体结构和动力学
• 克里斯多夫佩恩*博士(DGP)干细胞表观遗传学和干细胞生态位
• 组蛋白修饰(DGP)分子机制
• Sadie Wignall博士(IBiS)卵母细胞减数分裂期间的染色体动力学
• 于金丹*博士(DGP)前列腺癌的遗传和表观遗传途径
• 张炜*,博士(DGP)复杂性状的遗传学和表观遗传学
2、基因表达和转录因子的调控
• Ravi Allada*, MD(IBiS)睡眠和昼夜节律的分子遗传学
• Erik Andersen*, PhD(IBiS)基因鉴定与疾病易感性
• Grant Barish*, MD(DGP)炎症和代谢的转录调节因子
• Joseph Bass*, MD,PhD(DGP)糖尿病和肥胖症发展中的昼夜节律和代谢基因网络
• Jason Brickner*, PhD(IBiS)细胞核的空间组织和基因表达
• Debabrata Chakravarti*, PhD(DGP)激素信号转导和染色质修饰
• John Crispino*博士(DGP)正常和恶性血细胞发育的转录调控
• Marco Gallio*,博士(IBiS)大脑中温度刺激的处理
• 杰米•加西亚-阿诺韦罗斯*,博士(DGP)感觉和发育神经生物学
• 杰夫•堪萨斯*博士(DGP)造血细胞中Fut7的转录控制
• Carole LaBonne*, PhD(IBiS)神经嵴细胞的形成、迁移和分化
• Vijay Sarthy*,博士(DGP)脊椎动物视网膜的基因调控、发育和功能组织
• 比阿特丽斯•索萨-皮内达*博士(DGP)homeodomain-containing转录因子在胰腺和肝脏器官发生中的作用
• Alex Stegh*, MD,PhD(DGP)定义和靶向胶质母细胞瘤的肿瘤基因组
• Eric Weiss*,博士(IBiS)信号通路在细胞结构的控制
• 吴珍*, MD,PhD(DGP)调控基因表达的分子机制及其在年龄相关性疾病发病中的作用
3.人类遗传疾病的动物模型
• Joseph Bass*, MD,PhD(DGP)糖尿病和肥胖症发展中的昼夜节律和代谢基因网络
• Greg Beitel*,博士(IBiS)器官形态发生的分子遗传学
• Thomas Bozza*,博士(IBiS)分子遗传学和嗅觉生理学
• Richard Carthew*博士(IBiS)RNAi与基因调控
• 杰玛•卡维尔*,博士(DGP)癫痫的遗传原因和致病机制
• 蔡宰赫*, MD,PhD(DGP)遗传和获得性免疫性疾病和皮肤病的遗传基础
• John Crispino*博士(DGP)正常和恶性血细胞生长的机制
• Christine DiDonato*博士(DGP)脊髓性肌萎缩(SMA)的分子基础
• 冯元义*,博士(DGP)大脑皮层发育的细胞和分子机制
• 杰米•加西亚-阿诺韦罗斯*,博士(DGP)感觉和发育神经生物学
• Alfred George, Jr.*,MD(DGP)离子通道和通道病的结构、功能、药理学和分子遗传学
• Richard Green*,医学博士(DGP)胆汁淤积性肝病和脂肪肝疾病的遗传学和分子生物学
• Robert Holmgren*,PhD(IBiS)开发过程中的细胞命运规范
• Jennifer Kearney*,博士(DGP)癫痫的遗传基础
• Dimitri Krain c*, MD,PhD(DGP)神经退行性疾病中神经元功能障碍的机制
• Carole LaBonne*, PhD(IBiS)神经嵴细胞的形成、迁移和分化
• Nikia Laurie*, PhD(DGP)视网膜母细胞瘤进展的分子机制
• 马永超*,博士(DGP)运动神经元和多巴胺能神经元功能在发育和疾病中的调节
• Puneet Opal*, MD,PhD(DGP)神经变性的细胞基础
• P. Hande Ozdinler*,博士(DGP)肌萎缩侧索硬化症和相关疾病中运动神经元回路变性的皮层成分
• Teepu Siddique*, MD(DGP)神经退行性疾病的原因、机制和建模
• Fred Turek*,博士(IBiS)睡眠和昼夜节律
• 王晓忠(Alec)*, PhD(IBiS)中枢神经系统原黏蛋白多样性的遗传分析
• 吴珍*, MD,PhD(DGP)调控基因表达的分子机制及其在年龄相关性疾病发病中的作用
4.新的遗传技术和生物信息学
• Rosemary Braun*, PhD,MPH(IBiS)在生物系统的背景下分析高通量基因组数据
• Ramana Davuluri*,博士(DGP)转化生物信息学和癌症基因组学
• 侯丽芳*, MD,PhD(DGP)疾病的环境、遗传和表观遗传危险因素
• Elizabeth McNally*, MD,PhD(DGP)遗传性人类疾病的遗传机制
• Minoli Perera*,药学博士(DGP)少数患者群体的药物基因组学研究
• Ishwar Radhakrishnan*,博士(IBiS)高分子配合物的结构、功能、动力学和信息学
• Jonathan Silverberg*, MD,PhD,MPH(DGP)皮肤流行病学
• Matthew Schipma博士,NGS核心设施技术总监
• Justin Starren*,医学博士(DGP)医疗保健计算
• 王吉平,博士, 生物信息学与基因组学
• 黛博拉•温特*,博士(DGP)计算免疫学
• 张炜*,博士(DGP)复杂性状的遗传学和表观遗传学
5.复杂疾病的遗传学
• Ravi Allada*, MD(IBiS)睡眠和昼夜节律的分子遗传学
• Grant Barish*, MD(DGP)BCL6在糖原异生、饮食诱导肥胖和胰岛素抵抗中的作用
• Joseph Bass*, MD,PhD(DGP)糖尿病和肥胖症发展中的昼夜节律和代谢基因网络
• 杰玛•卡维尔*,博士(DGP)癫痫的遗传原因和致病机制
• 蔡宰赫*, MD,PhD(DGP)遗传和获得性免疫性疾病和皮肤病的遗传基础
• 邓汉翔,医学博士
• Alfred George, Jr.*,MD(DGP)离子通道和通道病的结构、功能、药理学和分子遗传学
• Geoffrey Hayes*博士(DGP)进化群体遗传学和遗传流行病学
• Jennifer Kearney*,博士(DGP)癫痫的遗传基础
• Peter Kopp*, MD(DGP)甲状腺和其他内分泌疾病的分子遗传学
• William Lowe*, MD(DGP)IGF-1基因表达与糖尿病遗传学
• Elizabeth McNally*, MD,PhD(DGP)心脏和肌肉疾病基因和修饰剂
• Minoli Perera*,药学博士(DGP)少数患者群体的药物基因组学研究
• Teepu Siddique*, MD(DGP)神经变性和肌萎缩侧索硬化的分子基础
• Margrit Urbanek*, PhD(DGP)复杂疾病易感基因
6.临床遗传学、个性化医学、遗传咨询以及遗传学的伦理、社会和法律方面。
• 劳伦斯•詹宁斯,医学博士, 新型分子检测
• Peter Kopp*, MD(DGP)甲状腺和其他内分泌疾病的分子遗传学
• 苏珊娜•奥尼尔,硕士,博士,CGC 定量遗传学
• Maureen Smith, MS,CGC 全基因组研究
• Cathy Wicklund, MS,CGC 遗传咨询
• Laurie Zoloth博士, 生物伦理学