微生物科学家在改善我们的生活质量方面发挥着重要作用，例如抗菌治疗、食品安全和植物遗传学。博士级微生物学家在政府，高等教育和私营企业的研究设施和领域对微生物进行独立研究。具有微生物学高级培训的医学博士追求科学家 - 实践者的道路，而拥有哲学博士学位的科学家追求多种研究路径，包括医学或其他领域。

微生物学医学博士
在微生物学方面增加以医学为重点的课程（例如免疫学和肿瘤学）的医学生与该计划中的其他学生具有相同的课程作业，例如微生物或病毒，研究机会和要求。医学生课程通常由美国国立卫生研究院全额资助，包括双学位、医学博士和博士课程。医学博士和博士医学重点课程之间的主要区别在于医学培训和时间承诺，例如博士学位的四到五年本质上，微生物学课程在医学博士培训的中间增加了额外的完成时间，典型的双元制课程持续八年。然而，除了微生物学研究之外，科学家从业者还接受过从事临床实践的医学培训，而博士科学家则没有。

微生物学专业医学博士
弗吉尼亚州里士满的弗吉尼亚联邦大学提供全额资助的双元制课程，专注于微生物学和研究机会，如癌症生物学或传染病。纽约布朗克斯的叶史瓦大学提供了一个全额资助的计划，强调综合医学和研究生课程，微生物学和免疫学的可用浓度，以及与250个研究小组之一进行研究的能力，例如转化医学。马里兰州贝塞斯达的NIH提供全额资助的医学研究学者为期一年的计划，该计划将未入学的医学博士学生带到他们居住的NIH主校区，在研究人员的指导下学习和进行研究。

微生物学博士
研究生博士微生物学课程与医学博士课程相同，双学位课程以医学为重点;然而，许多项目是非医疗的，例如农业或生物能源。在这些课程中，学生学习肥料补充剂的微生物接种剂、啤酒生产中的微生物活性、解毒废物的微生物菌株或确定工业过程代谢途径的方法等领域的课程。拥有微生物学博士学位的毕业生可能会开发医疗产品，但他们同样有可能开发用于生物能源的新生物质技术，用于造纸中酶的重组DNA技术或抗病植物遗传学方面的工作。完成通常没有资助的博士课程的时间通常是四到五年，就业机会集中在研究上。

微生物学博士
南达科他州立大学布鲁金斯分校（South Dakota State University of Brookings， S.D.）提供为期四年的无资助博士课程，学生可以进行自己的研究，例如应用微生物学，如土壤微生物生态学或植物基因组学。位于马萨诸塞州剑桥的麻省理工学院提供全额资助的博士学位，学生被整合到10个不同部门的课程中，这些部门研究微生物学，如生物能源和代谢多样性，环境微生物学或进化生物学。